Scientific articles, posters and talks.

2026

Reconstruction de graphes de recombinaison ancestraux et modélisation de phénotypes par la théorie des circuits

Presentation for UQAM's institutional final of ma thèse en 180 secondes.

Moonshine.jl: a Julia package for genome-scale model-based ancestral recombination graph inference

Forthcoming in Frontiers in Genetics

This article presents Moonshine.jl, a Julia package for ancestral recombination graph inference. The main algorithms are presented along with benchmarks of accuracy and computational performance.

2025

Vraisemblance pour phénotypes via résistance génétique

Poster for the STAGE-Québec workshop. It is my first attempt at designing a poster with Typst.

Vraisemblance pour phénotypes via résistance génétique

Talk for the STAGE-Québec workshop. It is my first attempt at creating slides with Typst.

2023

Less is More…or Is It? Comparing Methods to Predict Patient Flow in Alberta Emergency Departments

Honorable mention at the 2023 Statistical Society of Canada annual meeting

Poster for the case studies competition. We compared the performance of approaches based on neural networks and linear mixed models for forecasting occupancy and waiting times in emergency departments of hospitals in Alberta.

2022

Score de risque polygénique et épistasie: une approche « model free » basée sur le processus de coalescence

Le score de risque polygénique constitue un des outils de prédilection de la médecine personnalisée. Il ne s’agit ni plus ni moins que du risque, pour un individu donné, de développer une maladie. Le calcul de ce risque est basé sur les données massives provenant d’études d’association pangénomiques et traditionnellement effectué à l’aide de modèles linéaires généralisés. Une des faiblesses de ces modèles est la difficulté de la prise en compte de l’interaction entre les marqueurs génétiques (i.e. de l’épistasie). Nous proposons une méthode alternative qui vise à résoudre ce problème en évitant la spécification d’un modèle pour l’interaction.

2019

Modelling Horizontal Gene Transfer in Bacteria via Conditional Ancestral Recombination Graphs

Poster for the 8th Annual Canadian Human and Statistical Genetics Meeting organized by the Canadian Institutes of Health Research – Institute of Genetics.

Modelling Horizontal Gene Transfer in Bacteria

Contributed talk for the 2019 Statistical Society of Canada annual meeting held in Calgary.

2018

A New Proposal Distribution for Gene Mapping via ARGs

Poster for the New Statistical Methods for Family-Based Sequencing Studies workshop held at the Banff International Research Station.

MoonShineR: Gene Mapping Based on the Ancestral Recombination Graph.

Contributed talk for the R à Montréal meeting.

Gene Mapping Using Sequentially Constructed Ancestral Recombination Graphs

Contributed talk for the 2018 Statistical Society of Canada annual meeting held in Montreal.